Действие происходит в 1916 году, Круиз по Джунглям начинается с того, что смелый ботаник доктор Лили Хоутон крадет наконечник амазонской стрелы у элитного и анти-женского клуба британских исследователей. Украденный артефакт должен привести отважную героиню в таинственное место на реке Амазонке, где на древнем дереве цветут легендарные целебные цветы. Лили и ее брат МакГрегор отправляются в путь и нанимают дерзкого шкипера Фрэнка Вольфа, чтобы тот сопровождал их в опасном речном путешествии. По пути доктор Хоутон и Фрэнк должны избегать не только природных опасностей Амазонки, но и злодейского немецкого принца, также разыскивающего дерево, и группу испанских конкистадоров, которым нужны лепестки цветка, чтобы повернуть вспять свое проклятие бессмертия.